L'altare maggiore è un polittico composto da cinque pannelli in legno scolpiti, dipinti e dorati nei quali vengono rappresentati la Dormizione della Vergine ed episodi della vita di Cristo e della Vergine. Costruito da Veit Stoss e consacrato nel 1489 è alto 13 metri e largo 11, è nel suo genere tra le opere medioevali di maggiori dimensioni rispetto alle altre. L'altare fu durante l'occupazione tedesca nel 1940 deportato per Germania, nel 1946 è tornato in Polonia e dal 1957 si trova sul sito originale